Các phòng sạch được kiểm soát và sử dụng bởi vô số ngành công nghiệp khác nhau, trong đó các mầm bệnh và các hạt không khí khác phải được giữ ở mức tối thiểu. Một khu vực phòng sạch không chỉ đơn giản là một khu vực mà còn sạch cả về số lượng hạt và số lượng vi sinh vật, được đánh giá và kiểm tra nghiệm ngặt, khắt khao. Việc vệ sinh và làm sạch một công trình phòng sạch nên được thực hiện theo quy định và tiêu chuẩn đạt chuẩn.
Các phòng sạch được kiểm soát và sử dụng bởi vô số ngành công nghiệp khác nhau, trong đó các mầm bệnh và các hạt không khí khác phải được giữ ở mức tối thiểu. Ở một mức độ, một khu vực phòng sạch chỉ đơn giản là một khu vực mà là sạch cả về số lượng hạt (như quy định trong tiêu chuẩn phòng sạch ISO14644 quốc tế) và số lượng vi sinh vật (như được định nghĩa trong một tiêu chuẩn phòng sạch thứ hai để kiểm soát biocontamination, ISO14698). Việc vệ sinh và làm sạch một công trình phòng sạch nên được thực hiện theo quy định và tiêu chuẩn nghiêm ngặt. Làm sạch không đúng cách đối với các phòng sạch có thể dẫn đến ô nhiễm và giảm chất lượng sản phẩm khi đến tay người tiêu dùng.
Giẻ lau phòng sạch, sử dụng khăn hoặc giẻ lau không để lông, máy hút bụi kiêm hút nước phòng sạch, cần sử dụng máy hút bụi chuyên dụng có 3 tầng lọc, dùng tấm lọc HEPA để tránh tình trạng để lại hạt bụi. Hoặc túi lọc ULPA để loại bỏ hạt bụi nhỏ hơn nữa. Đối với khu vực tường trần vách panel của khu vực phòng sạch được thực hiện bằng khăn lau phòng sạch chuyên dụng (sử dụng khăn lau không để lại bụi, lông từ khăn), làm sạch bụi bẩn bám trên bề mặt. Bảo hộ dùng cho nhân viên vệ sinh phòng sạch: quần áo phòng sạch, mũ, giày, khẩu trang, găng tay phòng sạch. Hóa chất dùng cho phòng sạch cần kiểm soát chặt chẽ theo quy định
